Методы биохимических исследований

Скачать 0.55 Mb.

Название	Методы биохимических исследований
страница	5/6
Тип	Самостоятельная работа

rykovodstvo.ru > Руководство эксплуатация > Самостоятельная работа

1 2 3 4 5 6

Вопросы для самоконтроля.

Что такое ПЦР? Суть метода.
История разработки современной методики ПЦР.
Что нового предложил Мюллис?
Какие усовершенствования в методике были сделаны в1986 году?
Назовите алгоритм проведения ПЦР.
Участки какой длины можно амплифицировать, используя ПЦР?
Перечислите компоненты реакции ПЦР.
Как действует добавление пирофосфатазы на выход ПЦР?
Что называется праймером ПЦР?
Что называется амплификатором?
Каким образом можно сделать вывод об успешности проведения ПЦР?
Что называется ампликоном?
Сколько циклов обычно выполняется при проведении ПЦР?
Из каких стадий состоит цикл ПЦР?
В каких сферах деятельности используется ПЦР?
В чем состоит ПЦР-диагностика при определении возбудителя заболевания?
В чём преимущества ПЦР как метода диагностики?

Литература к теме 8:

Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. 3-е изд., Москва : Медицина, 2007.
Ельяшевич М.А. Молекулярная спектроскопия. М.: Либроком, 2009.
Николаев, А. Я. Биологическая химия : учеб. / А. Я. Николаев. – 3-е изд., перераб. и доп. – М., 2007.
Жимулев, И. Ф. Общая и молекулярная генетика : учеб. пособие / И. Ф. Жимулев. – Новосибирск, 2005.
Коничев, А. С. Молекулярная биология: учеб. / А. С. Коничев,Г. А. Севастьянова. – М. : Академия, 2005.
Ченцов, Ю. С.Введение в клеточную биологию : учеб. для вузов / Ю. С. Ченцов. – 4-е изд., перераб. и доп. – М. : Академкнига, 2005.
Кларк, Д. Молекулярная биология / Д. Кларк, Л. Рассел. – М., 2004.
Глик Б., Пастернак Дж. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение. Пер. с англ. — М.: Мир, 2002.
Патрушев Л. И. Искусственные генетические системы. — М.: Наука, 2005. — В 2 т.

10.Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия. — Новосибирск: Сиб. унив. изд-во, 2004.

11. Каледин А. С., Слюсаренко А. Г., Городецкий С. И. // Биохимия. — 1980. — T. 45.

12.Kalendar R, Lee D, Schulman AH 2011. Java web tools for PCR, in silico PCR, and oligonucleotide assembly and analysis. Genomics, 98(2).

Указания по написанию реферата.

Одной из форм самостоятельной работы студентов является написание

реферата. Реферат – краткое описание рецензируемых текстов с набором

ключевых понятий и основных положений. Работа над рефератом способствует повышению общей и профессиональной эрудиции студентов. Реферирование может быть посвящено отдельной проблеме или содержать обобщение разных точек зрения по определенной теме. Автор реферата определяет свое отношение к рассматриваемым научным позициям, взглядам или определениям, принадлежащим различным авторам. Реферат должен представлять собой научную ценность, поэтому подход студента к написанию реферата должен иметь исследовательский характер. При подготовке реферата следует использовать монографии, обзоры и оригинальные научные статьи.

Выполнение реферативных работ осуществляется в несколько этапов: выбор темы, составление плана, проработка литературных источников с их

анализом, написание и защита реферата. Тема реферата выбирается из рекомендованного списка или по предложению студента (с согласия преподавателя).

Рекомендуемый объём реферата – около 20 страниц компьютерного набора через 1,5 интервала. Высота букв (кегль) – 14. Текст должен быть напечатан на одной стороне стандартного листа белой бумаги формата А4

(210 х 297 мм). Страницы должны иметь поля: левое – 30 мм; верхнее – 25 мм; правое – 15 мм; нижнее – 20 мм. Страницы нумеруются вверху (от центра). К реферату прилагается презентационный материал, включающий

около 10 слайдов. Структура реферата и правила оформления рисунков, схем, цитируемой литературы аналогичны требуемым для курсовых и дипломных работ.

Темы рефератов

для самостоятельной работы студентов

1. Проблемы выделения в индивидуальном виде компонентов из живых организмов.

2. Нативность белков и нуклеиновых кислот.

3. Физико-химические свойства белков.

4. Основные принципы выделения и очистки белков.

5. Физико-химические свойства нуклеиновых кислот.

6. Основные принципы выделения и очистки нуклеиновых кислот.

7. Принцип метода гель-фильтрации.

8. Определение молекулярной массы молекул методом гель-фильтрации.

9. Разрешающая способность метода гель фильтрации.

10.Растворы используемые при экстракции белков.

11.Основные принципы разделения белков.

12.Метод высаливания белков.

13.Метод изоэлектрического фокусирования.

14.Очистка белковых растворов от низкомолекулярных примесей.

15.Принципы определения гомогенности белка.

16.Методы определения молекулярной массы белка.

17.Определение молекулярной массы белка методом гель-фильтрации.

18.Основные принципы хроматографии.

19.Основные типы хроматографии, используемые при выделении и очистке белков.

20.Физические и химические механизмы лежащие в основе абсорбционной хроматографии.

21.Области применения разных видов хроматографии.

22.Электрофорез биологических молекул.

23.Физические и химические механизмы лежащие в основе электрофореза.

24.Разновидности электрофореза биологических макромолекул.

25.Гель-электрофореза ДНК.

26. Гель-электрофореза белков

27.Разделение нуклеиновых кислот и белков в гомогенатах биологического материала.

28.Методы выделения ДНК.

29.Методы очистки ДНК.

30.Физические и химические процессы, происходящие в процессе выделения ДНК.

31.Отличия нативной, денатурированной и ренатурированной ДНК.

32.Гиперхромный эффект ДНК.

33.Задачи, которые можно решать используя абсорбционную спектроскопию ДНК.

34.Принципы метода ПЦР.

35.История разработки современной методики ПЦР.

36.Алгоритм проведения ПЦР.

37.Области применения ПЦР.

38.Преимущества ПЦР как метода диагностики.

Список рекомендуемой литературы

Ельяшевич М.А. Молекулярная спектроскопия. М.: Либроком, 2009.
Николаев, А. Я. Биологическая химия : учеб. / А. Я. Николаев. – 3-е изд., перераб. и доп. – М., 2007.
Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. 3-е изд., Москва : Медицина, 2007.
Жимулев, И. Ф. Общая и молекулярная генетика : учеб. пособие / И. Ф. Жимулев. – Новосибирск, 2005.
Коничев, А. С. Молекулярная биология: учеб. / А. С. Коничев,Г. А. Севастьянова. – М. : Академия, 2005.
Патрушев Л. И. Искусственные генетические системы. — М.: Наука, 2005. — В 2 т.
Ченцов, Ю. С.Введение в клеточную биологию : учеб. для вузов / Ю. С. Ченцов. – 4-е изд., перераб. и доп. – М. : Академкнига, 2005.
Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия. — Новосибирск: Сиб. унив. изд-во, 2004.
Кларк, Д. Молекулярная биология / Д. Кларк, Л. Рассел. – М., 2004.
Биохимия: Учеб. для вузов / Под ред. Е.С. Северина, Москва : ГЭОТАР-МЕД, 2003.
Глик Б., Пастернак Дж. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение. Пер. с англ. — М.: Мир, 2002.
Остерман Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. М.: МЦНМО, 2002.
Эллиот, В. Биохимия и молекулярная биология / В. Эллиот, Д. Эллиот ; под ред. А. И Арчакова, М. П. Кирпичникова, А. Е. Медведева, В. П. Скулачева. – М., 2002.
Elliott. – Oxford : University Press, 2002.
Остерман Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. М.: МЦНМО, 2002.
Филиппович Ю.Б. Основы биохимии. – 4-е издание, перераб. и доп. - М: изд-во "Агар", 1999.
Аффинная хроматография: Методы. Под ред. П.Дин, У.Джонсона, Ф.Мидл. М.: Мир, 1988.
Гааль Э., Медьеши Г., Верецкеи Л. Электрофорез в разделении биологических макромолекул. М. Мир, 1982.
Каледин А. С., Слюсаренко А. Г., Городецкий С. И. // Биохимия. — 1980. — T. 45.

Перечень примерных контрольных вопросовк зачету по курсу «Методы биохимических исследований»

Перечислите проблемы выделения в индивидуальном виде компонентов из живых организмов.
В чем состоит функциональная роль буферных систем организма?
Как готовят буферные растворы?
От чего зависит рН буферных растворов?
Как влияют на рН буферных растворов их разведение, а также добавление в раствор кислоты или щелочи?
Что понимают под нативностью белков и нуклеиновых кислот?
Физико-химические свойства белков: молекулярная масса, заряд белковых молекул, оптические свойства, растворимость, денатурация.
Каковы основные принципы выделения и очистки белков?
Физико-химические свойства нуклеиновых кислот: молекулярная масса, заряд молекул, оптические свойства, растворимость, денатурация.
Каковы основные принципы выделения и очистки нуклеиновых кислот?

11.Что представляют из себя молекулярные сита?

12.В чем заключается принцип метода гель-фильтрации?

13.На чем основывается процесс фракционирования молекул при гель-фильтрации?

14.Какие гель-матрицы применяются для гель-фильтрации?

15.Каковы основные параметры гель-фильтрационной колонки?

16.Что называется свободным объемом колонки?

17.Объясните, что называется гель-фильтрационными диаграммами элюирования веществ?

18.Как определить молекулярную массу молекул методом гель-фильтрации?

19.Каковы основные принципы выбора типа геля, размеров колонки, условий элюирования?

20.Какова разрешающая способность метода гель фильтрации?

21.Перечислите основные этапы гель-фильтрации белков.

22.Для каких целей необходимо получение индивидуальных белков?

23.Почему большинство методов органической химии, применяемых для выделения того или иного вещества из смеси, обычно не подходит для выделения белков?

24.Перечислите стадии поучения индивидуального белка в гомогенном виде.

25.Назовите методы гомогенизации биологических материалов при выделении белка.

26.Какие растворы используются при экстракции белков из гомогенатов?

27.Каким образом нерастворимые фракции отделяют от экстрактов белков?

28.Каковы основные принципы разделения белков?

29.Перечислите методы фракционирования белков.

30.Перечислите диапазон применимости каждого метода фракционирования белков.

31.Назовите преимущества и недостатки имеющихся методов фракционирования белков.

32.На чем основано разделение белков путем их осаждения?

33.Какие реактивы применяют для разделения белков путем их осаждения?

34.На чем основан принцип фракционирования белков сульфатом аммония

35.Перечислите достоинства и недостатки разных способов разделения белков путем их осаждения.

36.Каковы основные этапы фракционирования белков сыворотки крови сульфатом аммония?

37.Перечислите основные этапы фракционирования белков сыворотки крови этанолом.

38.Опишите принцип метода изоэлектрического фокусирования белков.

39.Каким образом белковые растворы очищают от низкомолекулярных примесей?

40.Назовите принципы определения гомогенности белка.

41.Назовите методы определения молекулярной массы белка.

42.В чем состоят основные принципы хроматографии биологических молекул?

43.Назовите основные типы хроматографии, используемые при выделении и очистке белков.

44.Какие физические и химические механизмы лежат в основе абсорбционной хроматографии белков?

45.Какие физические и химические механизмы лежат в основе распределительной хроматографии белков.

46.Какие физические и химические механизмы лежат в основе ионообменной хроматографии белков?

47.Какие физические и химические механизмы лежат в основе афинной хроматографии белков.

48.Опишите сферы применения разных видов хроматографии белков.

49.В каких разделах биологических исследований применяется электрофрорез?

50.Для каких целей в биологии используется электрофорез?

51.Какие физические и химические механизмы лежат в основе электрофореза?

52.Назовите используемые разновидности электрофореза биологических макромолекул.

53Для каких целей используют электрофорез белковых молекул?

54.Охарактеризуйте методику электрофореза белков в полиакриламидном геле по Лэммли.

55.Перечислите и охарактеризуйте разновидности и модификации методики электрофореза белков в полиакриламидном геле по Лэммли.

56.На чем основано электрофоретическое разделение ДНК?

57.Для каких целей используют электрофорез ДНК?

58.В каких случаях используют электрофорез ДНК в полиакриламидном геле, а в каких случаях в агарозном геле?

59.Охарактеризуйте метод электрофореза в пульсирующем электрическом поле.

60.Опишите алгоритм проведения гель-электрофореза ДНК.

61.Какими способами можно определить положение различных фрагментов ДНК в гелях после проведения электрофореза?

62.Какими параметрами определяется скорость миграции ДНК в геле при электрофорезе?

63.Как разъединить нуклеиновые кислоты и белки в гомогенатах биологического материала?

64.Охарактеризуйте фенольный метод выделения ДНК.

65.Опишите хлороформ-изоамиловый метод выделения ДНК.

66.Перечислите способы фракционирования смеси нуклеиновых кислот.

67.Опишите метод разделения нуклеиновых кислот ультрацентрифугированием в градиенте плотности хлористого цезия.

68.Перечислите методы минипрепаративного выделения и охарактеризуйте их.

69.Какие приемы применяются для освобождения препаратов ДНК от примесей РНК?

70.Перечислите основные этапы выделения ДНК из биомассы бактерий.

71.Каких проблем следует избегать при выделении ДНК?

72.В чем состоит принцип определения концентрации ДНК спектрофотометрическим методом?

73.Каковы спектрофотометрические критерии чистоты препаратов ДНК?

74.Перечислите основные этапы очистки препаратов ДНК.

75.Как определить концентрацию и качество исходного нативного образца ДНК?

76.Чем отличаются от исходного образца ДНК денатурированная и ренатурированная ДНК?

77.Какие процессы влияют на спектры поглощения ДНК?

78.В чем состоит гиперхромнный эффект ДНК?

79.Какие задачи можно решать используя абсорбционную спектроскопию ДНК?

80.Для каких целей в биохимии используются эндонуклеазы рестрикции?

81.На чем основаны принципы использования эндонуклеаз рестрикции?

82.Каковы оптимальные условия реакций рестрикции?

83.Какие буферы используются для проведения реакций рестрикции?

84.Какие задачи необходимо решать при проведении рестрикционного анализа ДНК?

85.Перечислите основные этапы проведения рестрикционного анализа ДНК.

86.Какие операции нужно совершить после для проведения реакций рестрикции?

87.Как оценить размер полученных рестриктов?

88.Как оценить качество рестрикции (полноту расщепления пробы)?

89.Какую информацию можно получить при расщеплении ДНК определенной молекулярной массы двумя рестриктазами одновременно?

90.В чем состоит проблема при использовании метода расщепления ДНК двумя рестриктазами одновременно?

92.Охарактеризуйте суть метода ПЦР.

93.Каков алгоритм проведения ПЦР.

94.Участки какой длины можно амплифицировать, используя ПЦР?

95.Перечислите компоненты реакции ПЦР.

96.Что называется праймерами при проведении ПЦР?

97.Каким образом можно сделать вывод об успешности проведения ПЦР?

98.Что называется ампликонами?

99.Из каких стадий состоит цикл ПЦР?

100.В чём состоят достоинства метода ПЦР?

1 2 3 4 5 6

	Тема современные методы системных исследований Основные направления социологических исследований. Методы, используемые в рамках социологических исследований. Методологическая стратегия...		Документация об открытом аукционе в электронной форме на поставку... На поставку реагентов для иммунохимических (иха) и биохимических исследований на анализаторах Cobas, и для гематологических исследований...
	Программа дисциплины «Методы научных исследований в менеджменте» Программа предназначена для преподавателей, ведущих данную дисциплину, учебных ассистентов и студентов направления подготовки/ специальности...		Правила сбора мочи для биохимических гормональных исследований С-пептид, метанефрины и норметанефрины, адреналин, норадреналин, дофамин, серотонин, гистамин и др
	Методические рекомендации по изучению дисциплины «Методы исследований... Целью освоения дисциплины «Методы исследования в социальной работе» является формирование целостной системы знаний об основных общенаучных...		Отдел биохимических, микологических, химико-токсикологических исследований... Пнд ф 14. 1 98-97 Методика выполнения измерений жесткости в пробах природных и очищенных сточных вод титриметрическим методом
	Рефератов по дисциплине «психологический практикум» Методы быстрой, не требующей специальных исследований диагностики существенных индивидуальных		Методы исследования в биологии (10 класс) Цель: создать условия для осмысления информации об основных методах биологических исследований
	Рабочая программа для студентов направления подготовки 44. 03. 01 Педагогическое образование Содержание: умк по дисциплине Методология и методы психолого-педагогических исследований		Учебно-методический комплекс дисциплины «Методы маркетинговых исследований» ...
	Программа дисциплины «Методы научных исследований в менеджменте» Программа предназначена для преподавателей, ведущих данную дисциплину, учебных ассистентов и студентов направления 38. 03. 02 «Менеджмент»...		Вопросы "А" Связь физиологии с другими науками. Методы физиологических исследований и история их развития (наблюдение, исследование биоэлектрических...
	Методы исследования в природе с учащимися Для этих целей используются как традиционные средства полевых исследований (бинокль, видеокамеры), так и сложное лабораторное оборудование...		Область аккредитации испытательной лаборатории (центра) производственно-аналитической... Правила и методы исследований (испытаний) и измерений, в том числе правила отбора проб
	Институт ядерных исследований учёный совет Институт ядерных исследований Российской академии наук образован в 1970 году для создания экспериментальной базы и проведения фундаментальных...		Законодательством Российской Федерации Государственного университета – Высшей школы экономики (далее по тексту – гу-вшэ), работающего по должности аналитика Лаборатории...

Методы биохимических исследований

Похожие: