Тема
|
Виды учебной
работы
|
Используемые интерактивыне образовательные технологии
|
Количество
часов
|
Тема 1.
Предмет и структура курса. Роль компьютера в научной работе.
Практика работы с файловыми менеджерами на примере программы Far.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 2.
Представление результатов в виде статей, презентаций, web-публикаций. Средства для создания презентаций.
Система подготовки научных публикаций TeX/LaTeX. История возникновения системы TeX. Отличие системы TeX/LaTeX от текстовых процессоров и редакторов. Дистритбутивы. Графические надстройки над системой. Этапы создания документа в системе TeX/LaTeX
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 3.
Основы работы в TeX/LaTeX. Запуск системы. Компиляция. Обработка ошибок. Набор и оформление простого текста. . Набор и оформление математических и химических формул.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 4.
Основы работы в TeX/LaTeX. Набор и оформление таблиц. Составление списков и библиографии.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 5.
Основы работы в TeX/LaTeX. Графические возможности системы.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 6.
Компьютерное моделирование в химических исследованиях. Понятие структуры системы. Классификация структуры систем в вычислительном эксперименте. Функция радиального распределения и ее анализ.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 7.
Сравнительный анализ методов вычислительного эксперимента: метод молекулярной динамики и метод Монте-Карло.
Использование метода молекулярной динамики в химических исследованиях. Алгоритм Верле.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 8.
Методика расчета размеров расчётной ячейки. Периодические граничные условия. Cпособы описания межмолекулярного взаимодействия.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 9.
Силовые поля, используемые при моделировании молекулярных систем. Типичные примеры молекулярно-динамических расчетов.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 10.
Характеристика используемых пакетов прикладных программ при моделировании, изучении, визуализации структуры молекулярных систем.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 11.
Практика МД расчета с использованием пакета GROMACS. Методика настройки компьютера для данного пакета.
Описание структуры входных файлов.
Моделирование процесса охлаждения жидкого аргона.
Описание модели.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 12.
Практика МД расчета с использованием пакета GROMACS.
Моделирование процесса охлаждения газообразного аргона.
Методика создания входных файлов.
Выполнение предварительной оптимизации системы и анализ полученных данных.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой решение задач
Составление «калькулятора» в Ехcel для решения данных задач (автоматизация типовых вычислений).
|
0,49
|
Тема 13.
Практика МД расчета с использованием пакета GROMACS.
Моделирование процесса охлаждения газообразного аргона.
Описание настроек, необходимых для описания процесса охлаждения. Подготовка исходных файлов.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 14.
Практика МД расчета с использованием пакета GROMACS.
Моделирование процесса охлаждения газообразного аргона.
Выполнение расчета и анализ полученных данных.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 15.
Практика использования пакета VirtualDup для создания видеоролика, иллюстрирующего процесс охлаждения газообразного аргона.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 16.
Практика МД расчета с использованием пакета GROMACS.
Конструирование отдельных молекул.
Описание методики кодирования структуры молекулы и создание отдельных файлов.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
|
|
|
|
Тема 1.
Практика МД расчета с использованием пакета GROMACS.
Конструирование отдельных молекул.
Выполнение расчета.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 2.
Практика использования пакета FireFly. Получение лицензии. Методика настройки компьютера для данного пакета.
Описание методики создания входного файла и описание основных команд.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 3.
Практика использования пакета FireFly.
Выполнение тестового расчета и его анализ
Подготовка, выполнение и анализ учебных примеров
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 4.
Практика работы с химическими редакторами. Совместимость химических редакторов с текстовыми процессорами Использование химического редактора на примере программы ACDLABS.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 5.
Роль визуализации в научной работе. Программа GnuPlot. Основные возможности построения кривых и поверхностей, заданных формулами и экспериментальными точками. Использование сценариев.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 6.
Использование пакета GNUPlot для подбора коэффициентов эмпирических зависимостей.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 7.
Практика совместного использования пакетов Gromacs и FireFly.
Понятие о Z-матрице и методике ее создания. Пакет Авогадро.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 8.
Практика совместного использования пакетов Gromacs и FireFly.
Описание методики определения неизвестных констант для силового поля.(Часть 1)
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 9.
Практика совместного использования пакетов Gromacs и FireFly.
Описание методики определения неизвестных констант для силового поля.(Часть 2)
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 10.
Практика совместного использования пакетов Gromacs и FireFly.
Описание методики определения неизвестных констант для силового поля.(Часть 3)
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 11.
Системы компьютерной математики. Назначение систем компьютерной математики. Основные системы компьютерной математики. Их возможности для аналитического и численного решения математических задач.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 12.
Практика работы с программой компьютерной математики Maxima.
Знакомство с системой аналитических (символьных) вычислений Maxima.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 13.
Практика работы с программой компьютерной математики Maxima.
Графические возможности.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 14.
Практика работы с программой компьютерной математики Maxima.
Интегрирование и дифференцирование.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 15.
Практика работы с программой компьютерной математики Maxima.
Решение систем дифференциальных уравнений.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
Тема 16.
Практика работы с программой компьютерной математики Maxima
Применение программ компьютерной математики при решении задач химической кинетики
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,49
|
Тема 17.
Практика работы с программой компьютерной математики Maxima.
Методы ускорения расчетов в пакете Махimа. Написание сценариев.
|
Лабораторная работа, включающая в себя теоретический и практический блоки и блок самостоятельная работы
|
Лекция с элементами диалога, совместное группой выполнение практических заданий с использование необходимых по данной теме компьютерных технологий
|
0,48
|
