Руководство для пользователей linux кластера лит оияи

От редактора 4

1 Структура Linux кластера и базовое программное обеспечение 6

1.1 Интерактивный кластер 7

1.2 Вычислительные фермы 7

1.3 Серверы дискового пространства 8

1.4 Вспомогательные серверы 9

1.5 Базовое программное обеспечение 9

2 Начальные рекомендации пользователям 10

2.1 Как стать пользователем 10

2.2 Ваша "учетная запись" (account) и пароль 11

2.3 Безопасность 12

2.4 Пакетная обработка счетных задач 13

2.5 Дисковое пространство для пользователей 15

2.6 AFS и некоторые пользовательские файлы и каталоги 16

2.7 Электронная почта 17

2.8 Русификация 18

3 Файловая система AFS 19

4 Рекомендации для пользователей параллельного вычислительного кластера 23

4.1 Использование команды qsub 23

4.2 Описание параметров 24

4.3 Контроль над исполнением задачи 25

4.4 Результаты выполнения задачи в пакетной обработке 25

5 Перечень и краткое описание основных команд при работе в операционной системе Linux 25

5.1 Простейшие действия 26

5.2 Стандартные команды. Информация по системе команд 28

5.3 Работа с сетью 30

5.4 Некоторые команды администрирования 31

5.5 Контроль процессов 33

5.6 Встроенные в Linux программные утилиты и языки 33

6 Midnight Commander 35

7 Рекомендуемые редакторы 46

7.1 Текстовый редактор pico 46

7.2 Краткое описание редактора vi/vim 47

Режимы работы редактора 49

Командный режим 50

Bыход из редактора 55

8 Некоторые средства разработки программ 55

8.1 Текущие версии компиляторов 55

Компилятор С 57

Компилятор g77 58

8.2 Редактор связей ld 59

8.3 Команды ar, ranlib, nm, ldd, strings 60

7.4 Утилита gprof 61

8.5 Отладчики 62

GDB символьный отладчик GNU 62

Отладчик с визуальным отображением данных DDD 69

10Графические пакеты на Linux кластере 70

10.1 ImageMagick. Просмотр и обработка изображений. 70

10.2 Chimera 76

79

10.3 Системы визуализации массивов числовой информации 86

(научных данных) 86

Grace 86

IRIS Explorer 93

OpenDX (Data Explorer) 100

100

11 СУБД MySQL 106

11.1 Регистрация пользователей и создание базы данных 107

11.2 Соединение с сервером MySQL 107

11.3 Примеры работы с MySQL 109

11.4 Основные команды 111

11.5 Подключение к базе данных MySQL с использованием PHP 113

113

12 Изменения в работе с PHP-программами 116

Параметры PHP-программ 116

Обработка входных параметров 116

Системные переменные 118

13 Сведения об информационном сервере linux4u 119

14 Литература о Linux на русском языке 120

15 Сравнительное сопоставление прикладных пакетов в средах ОС Windows и Linux 121

16 Благодарности 122